Pełnomocnik realizuje zadania wynikające z właściwych ustaw i aktów wykonawczych, a w szczególności dotyczące:
1) zapewnienia ochrony informacji niejawnych, w tym stosowania środków bezpieczeństwa fizycznego;
2) zapewnienia ochrony systemów teleinformatycznych, w których są przetwarzane informacje niejawne;
3) kontroli ochrony informacji niejawnych oraz przestrzegania przepisów o ochronie tych informacji,
4) opracowania i aktualizowanie planu ochrony informacji niejawnych i nadzorowanie jego realizacji;
5) prowadzenia szkoleń w zakresie ochrony informacji niejawnych;
6) prowadzenia zwykłych postępowań sprawdzających oraz kontrolnych postępowań sprawdzających,